Pedro Onetto et Marta Roca Alonso ont composé des musiques spécialement pour Enfance Clandestine. C’est ce qu’on appelle la bande-originale du film.
Avec le réalisateur Benjamin Àvila, qui ne voulait pas une musique trop dramatique (le sujet l’étant déjà assez), ils ont décidé d’associer un genre de musique particulier à chaque personnage. Le thème musical principal du film est donc associé à Juan – puisqu’il est le personnage principal de l’histoire. Souviens toi, c’est cette mélodie qui revient à plusieurs reprises, du début à la fin, sur des variations différentes…